2025年全國河川嚴重污染測站僅剩2站，嚴重污染河段長度低於2%。環境部指出，在中央與地方攜手推動流域治理與相關工程下，整體水質已明顯改善。但面對極端氣候帶來的旱澇交替，以及地震導致土石鬆動與強降雨沖刷等因素，水質保護仍面臨嚴峻挑戰。
水質保護司司長王嶽斌表示，過去廿多年來，隨著經濟持續成長與產業發展，環境承受的污染負荷不斷增加。他說，工廠數量成長近三成，整體經濟規模（GDP）更成長超過1.5倍，也讓環境壓力持續攀升。
不過，根據最新監測結果，全國50條主要河川嚴重污染測站已降至歷史新低的2站，分別位於北港溪和平橋及二仁溪五空橋，RPI（河川污染指數）指標約為6.2，有機會脫離嚴重污染門檻。
進一步分析全台50條重點河川，有34條、約七成呈現穩定改善趨勢，顯示透過污水下水道建設、污染源削減措施及地方環保單位的長期投入，經濟發展與水質污染正逐步「脫鉤」。
至於其餘16條水質較不穩定的河川，多集中於東部地區。王嶽斌指出，主因在於極端氣候與地震頻繁，使土質鬆動後經豪雨沖刷，導致水體懸浮固體（SS）大幅增加，造成水質波動。
台南急水溪、二仁溪，新北淡水河成改善典範
台南市環保局局長許仁澤表示，過去污染情況較為嚴重的急水溪與二仁溪，在提升污水接管率、推動多點現地處理及強化專案執法後，水質已顯著改善。他說，急水溪流域生化需氧量（BOD）年平均濃度於過去15年間下降57.3%，已無嚴重污染監測站；二仁溪支流三爺溪的氨氮濃度也下降63%。
許仁澤指出，急水溪流域流經新營、柳營等畜牧業密集區，治理策略已由傳統末端稽查轉向「轉廢為能」的循環經濟模式。他說，政府與酪農合作設立「八翁里畜牧糞尿資源化中心」，將畜牧廢棄物轉化為沼氣發電，並將沼渣、沼液回歸農地再利用，有效改善長期困擾河川的感官污染問題。
二仁溪長年累積的電子廢棄物問題，也在中央補助下投入12億元推動整治，預計三年內完成清除。其支流三爺溪則透過加嚴銅放流水標準與專案稽查，使2025年事業採樣銅項目合格率達100%，氨氮濃度大幅下降63.0%。
不過，許仁澤也坦言，目前南部流域治理仍存在死角，尤其是飼養規模200頭以下、未列管的微型養豬場，場址多隱身於偏遠地區或林地之中，未申請合法證照，增加稽查難度；加上部分業者將排放管線暗埋至河床底部，從地表難以察覺，形成執法死角。他說，未來將透過專案稽查，並導入物聯網（IoT）感測技術，以補足監管缺口。
新北市環保局主秘許銘志則表示，淡水河流域的汙染以生活汙水為主，透過建立「基北北桃環保交流平台」突破行政區界，確保上下游治理同步推進。同時，新北市以全國最高的126萬戶污水下水道接管數為基礎，透過「環保智慧指揮中心」整合人工智慧與感測設備，針對夜間或雨天偷排行為進行精準稽查，讓淡水河嚴重污染比例由5.1%降至0.2%，並且讓碧潭堰等地的保育類生態重新回歸河廊。
氣候變遷壓力升高 水質治理邁入新挑戰
「影響水質的除了經濟活動，還有個挑戰就是氣候變遷，」王嶽斌指出，強降雨會增加沖刷、降低水體透明度，高溫則加劇藻類繁殖與優養化，枯水期則削弱河川自淨能力。
他說，在降雨不穩情況下，水庫為穩定供水多維持高水位運作，延長水體停留時間，也提高優養化風險。這些自然與人為因素交互作用，使未來水質管理更加複雜。為此，環境部鎖定26站關注測站、10站優先改善測站，推動四大治理策略，包括強化源頭污染削減、推動廢水資源化、守護上游水源地，以及提升資訊透明與公民參與，全面強化水質管理體系。
在制度面上，環境部將於2027年啟動新一階段管制，逐步加嚴氨氮與總磷排放標準，並授權地方政府依水體條件採取更嚴格規範。同時，修正《水污染許可審查辦法》，對重大違規業者採取縮短許可期限、核減排放量及追償不法利得等措施，以提升管理強度。
此外，環境部持續推動總量管制2.0及流域治理措施，並修正水質標準，納入PFAS基準及水域遊憩用途。在工程面，亦推進河川水質再淨化及畜牧廢水集中資源化設施，以提升治理效能。
在淨零與循環經濟政策下，事業廢水處理綠色轉型也是重要一環，環境部表示，2025年已完成15處示範案場，帶動約5億元投資；同時導入自動監測與AI技術，應用於流域預警及資訊平台，強化智慧治理與全民參與。
環境部次長葉俊宏表示，未來將持續精進制度與科技應用，目標2030年全台測站都要脫離嚴重污染。
流域要共好，民間參與及產業鏈整合是關鍵
要達成乾淨的流域環境，除了政府持續投入治理外，民間力量同樣不可或缺。長榮大學河川保育中心主任洪慶宜指出，面對中南部畜牧業高度密集所帶來的污染挑戰，現行示範計畫雖已展現成效，但仍需進一步從產業結構面著手，強化供應鏈的整合與連結。
洪慶宜認為，在全球ESG永續趨勢下，食品大廠應積極扮演關鍵角色，從供應鏈源頭管理原料來源，輔導農民轉型為「友善農業」，並實質參與流域整體治理，形成系統性的改善機制。
此外，民眾參與機制亦是推動治理的重要一環。洪慶宜強調，在各地公共治理的背後，皆有高度關注環境議題的在地居民支持，未來應進一步建構完善的「民眾參與網絡」。
透過公民力量的投入，不僅能成為政府推動流域管理的最佳助力，也有助於促進社會溝通，讓企業與消費者共同參與社區環境的永續改善。